中药学专业硕士学位点是广东药科大学最早获批的专业硕士学位点，依托二级单位为中药学院，学院始建于2003年，其前身为中药系，2005年更名为中药学院，经过20余年的建设，现已发展为华南地区具有一定影响、规模适当、结构合理的中药学教学与科研基地。于2010年获得中药学硕士专业学位授予权，截至目前为止，共招收硕士研究生1885人。 中药学院为全国中药特色技术传承人才培训基地、全国大学生文化素质教育基地、广东省青少年科技教育基地。2022年以来，新增了全国老药工传承工作室、广东省高校中华优秀传统文化传承基地、广东省高水平中医药学院培育建设单位、广东省数字化中药产业学院、广东省第四批高校中华优秀文化传承基地。中药学院教工第四党支部获批广东省第三批“双带头人”教师党支部、广东省第四批“双创”样板党支部。

中药学专业学位在教育部2022年学位评估中位列B+，学位点拥有14个省级研究生联合培养示范基地、12个省级以上教学科研平台、6个广东省高校教学和科技创新团队及2个广东省“扬帆计划”科技创新团队。

本学位点拥有一批高水平骨干教师，包括全国五一奖章获得者、教育部中药学类教学指导委员会委员、珠江学者、广东省教学名师、南粤优秀教师、广东省重点研发计划首席科学家等。其中各专业委员会委员30余人、省级、校级千百十培养对象及校级教学名师多人。